Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GpnmbQ99P91 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms