Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PtprtQ99M80 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PtprtQ99M80 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PtprtQ99M80 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprtQ99M80 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprtQ99M80 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprtQ99M80 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprtQ99M80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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PtprtQ99M80 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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