Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms