Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PpifQ99KR7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PpifQ99KR7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms