Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lims1Q99JW4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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