Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxp3Q99JB6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxp3Q99JB6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxp3Q99JB6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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