Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CsprsQ99388 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CsprsQ99388 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CsprsQ99388 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CsprsQ99388 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms