Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms