Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clip1Q922J3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms