Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Afg3l1Q920A7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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