Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms