Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms