Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mark1Q8VHJ5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms