Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc39cQ8VE09 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms