Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
RhovQ8VDU1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RhovQ8VDU1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms