Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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