Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot6Q8K3P5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms