Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ssh3Q8K330 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ssh3Q8K330 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ssh3Q8K330 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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