Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Abcf3Q8K268 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Abcf3Q8K268 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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