Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkn3Q8K045 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pkn3Q8K045 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pkn3Q8K045 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkn3Q8K045 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms