Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syn3Q8JZP2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms