Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clip4Q8CI96 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip4Q8CI96 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms