Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh4a1Q8CHT0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms