Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Upp2Q8CGR7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms