Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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