Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp27Q8CEG8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp27Q8CEG8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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