Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28bQ8CEG5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc28bQ8CEG5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc28bQ8CEG5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ccdc28bQ8CEG5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ccdc28bQ8CEG5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ccdc28bQ8CEG5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ccdc28bQ8CEG5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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