Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fbxo48Q8CAT8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo48Q8CAT8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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