Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc113Q8C5T8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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