Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TdrpQ8C5P7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms