Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdac7Q8C2B3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Hdac7Q8C2B3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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