Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccser1Q8C0C4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms