Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp398Q8BV16 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zfp398Q8BV16 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zfp398Q8BV16 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zfp398Q8BV16 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zfp398Q8BV16 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp398Q8BV16 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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