Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ8

Kcns3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns3Q8BQZ8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcns3Q8BQZ8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcns3Q8BQZ8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms