Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem260Q8BMD6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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