Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc2Q8BKV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpc2Q8BKV1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms