Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pum3Q8BKS9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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