Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc41a1Q8BJA2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms