Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd3Q8BHD4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmd3Q8BHD4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms