Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a9Q8BGD6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a9Q8BGD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms