Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf187Q8BFX1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf187Q8BFX1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf187Q8BFX1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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