Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms