Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc172Q810N9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms