Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc27Q80YS5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms