Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WhrnQ80VW5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WhrnQ80VW5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms