Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms