Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2q1Q7TSS2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms