Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dsg1bQ7TSF1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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