Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms