Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSA6

Proser3, Proline and serine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser3Q7TSA6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Proser3Q7TSA6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Proser3Q7TSA6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms